題目：基因組大數(shù)據(jù)輔助解析小麥條銹菌群體演化規(guī)律

主講：賀飛 研究員

時(shí)間：12月23日（周一）15:00

地點(diǎn)：登高樓一樓學(xué)術(shù)報(bào)告廳

主講人簡(jiǎn)介: 

賀飛，中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所研究員，中科院-英國(guó)約翰·英納斯中心（JIC）植物和微生物聯(lián)合研究中心（CEPAMS）課題組組長(zhǎng)。本科畢業(yè)于西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院，2011年在中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院獲得生物信息學(xué)博士學(xué)位，先后在美國(guó)斯隆凱特琳癌癥中心、布魯克海文國(guó)家實(shí)驗(yàn)室、堪薩斯州立大學(xué)從事博士后研究。長(zhǎng)期從事生物信息學(xué)與農(nóng)作物基因組學(xué)研究。2021年建立課題組以來(lái)，致力于利用基因組學(xué)解析小麥抗病育種的進(jìn)化機(jī)制。

報(bào)告簡(jiǎn)介：

隨著高通量測(cè)序技術(shù)的普及，越來(lái)越多的小麥條銹菌基因組被測(cè)序。公共數(shù)據(jù)庫(kù)中目前已經(jīng)積累了數(shù)百份條銹菌的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)來(lái)自世界各地的實(shí)驗(yàn)室、針對(duì)不同的菌株、有著不同的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與研究目的。我們對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行了整合，獲得了一張高密度SNP的遺傳多樣性圖譜。利用該圖譜，我們不僅觀察到了有性生殖的廣泛痕跡，還觀察到部分基因組區(qū)域存在重組被抑制的現(xiàn)象。結(jié)合比較基因組學(xué)分析，我們發(fā)現(xiàn)條銹菌基因組的雜合度并非是長(zhǎng)期無(wú)性繁殖的結(jié)果，而是由于核單倍型之間差異造成。所以，公共數(shù)據(jù)的整合分析能夠揭示小麥條銹菌的基因組演化規(guī)律。這些規(guī)律是否可以幫助定位無(wú)毒基因有待進(jìn)一步探索。

                歡迎廣大師生參加！

組織單位：農(nóng)學(xué)院